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発芽後間もなく、主根上部から胚軸部にかけて褐変し、子葉はしおれ、本葉は展開することなく地際から倒れ、枯死する。枯死後の子葉は糸状に細く縮れ、最後には痕跡のないまでになる。生育が進んだものでも発病し、下位葉から黄化、地際の胚軸が褐変してくびれ倒伏する。ともに高温期に発生し、症状も立枯病に極めて類似するが、立枯病が多湿条件下で発生するのに対して、株腐病はやや乾燥条件下で発生する。

病原：糸状菌（かび）　リゾクトニア　ソラニ
高温性の土壌伝染病菌であり、高温期の育苗は常に本病の危険にさらされる。
病原菌は菌核を作って被害作物残さ上で生存するほか、土壌中の新鮮有機物（植物の遺体）を利用して増殖することができる。

連作を避ける。
発病圃場では、リゾレックス粉剤を処理後播種する。また、クロールピクリン、キルパー、バスアミド微粒剤で土壌消毒する。