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生育全期間に発生する。発芽間もなく発病するものでは、子葉と本葉が黄化、萎凋する。本葉では、しばしば葉脈が網状に黄化する。葉の黄化は片側に強く現れることがよくあり、生長につれて奇形化する。主根の維菅束が褐変して枯死する。

病原：糸状菌（かび）　フザリウム　オキシスポラム　f．sp.　コングルティナンス
本病にかかったコマツナの体内、特に維菅束には、病原菌が蔓延して厚膜胞子（不良環境に耐えて長期間生きられる器官）が多数形成される。厚膜胞子は被害作物の遺体とともに土壌中に混入し、数年から最大十数年間生き残る。この土壌に再びコマツナが植えられると、厚膜胞子から発芽管が伸びて、コマツナの根の先端や傷口から体内に進入し、導管内で増殖する。寄生を受けたコマツナは、病原菌による栄養の収奪と導管の閉塞、さらに病原菌の産生する毒素によって生育が著しく阻害され、枯死に至る。
本病は典型的な土壌伝染性病害であり、一度、土壌が本病病原菌の汚染を受けると、病原菌は容易に駆逐されず、高温期にコマツナを植えれば必ず発病する。したがって病原菌を畑に入れないことが本病防除の第一歩である。本病病原菌の伝染の可能性は次の経路が考えられるので、これらを一つひとつ点検して、細心の注意を払って消去していくことが肝要である：種子、運搬用・耕運用大小農機具、農具、履き物、堆厩肥、潅漑水など。また強風や大水による汚染土壌の移動により広範な伝搬が起こる。
本病の発病適温は26〜30℃と高温である。25℃以下では、温度が低くなるにしたがい発病までの所要日数が長くなるが、18℃以上では発病の可能性はある。

連作を避けて、土壌中の病原菌密度の上昇を抑制する。発病株はできるだけ早めに抜き取って、地中深く埋めるか圃場外で処分する。その上で、下記の登録薬剤によって土壌消毒を行う。土壌消毒に際しては、ガスの逸散を防ぐため処理後直ちに被覆を行う。土壌消毒後の土壌は微生物活動が低下していて、病原菌が侵入・定着しやすいので、上記のようなさまざまな経路での伝染に特に注意する。
登録防除薬剤：バスアミド微粒剤、クロールピクリンなどによる土壌消毒が有効である。

注．2003年の改正農薬取締法施行にともなって、非結球あぶらな科葉菜類（こまつな、のざわな、みずな、チンゲンサイなど）という作物群が設定された。ここでは原則として、非結球あぶらな科葉菜類または野菜類全般に使用できる登録薬剤（作物によって使用時期、処理量などが異なる場合がある）を示した。