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主に下記の（１）（２）のウイルスの感染による。（１）では、葉が縮れたり、緑の濃い部分と薄い部分が入り交じり、モザイク状になる。被害が進むと、茎の先端部が糸のような細長い葉になったり、茎にえそを生じて落葉したり、株全体が萎縮することがある。（２）では、初め黄化症状を示し、後に紫褐色のえそ斑点を生じて落葉する。若い枝や葉柄にもえそを生じる。
ほかにソラマメウイルトウイルス（BBWV-2）など、数種のウイルスが感染し発病する。

病原：ウイルス
　（１）キュウリモザイクウイルス（CMV）
　（２）トウガラシ微斑ウイルス（PMMoV）
　（３）アルファルファモザイクウイルス（AMV）
　（４）ソラマメウイルトウイルス２（BBWV-2）
　（５）パプリカ微班ウイルス（PaMMV）
　（６）トウガラシ班紋ウイルス（PepMoV）
　（７）ジャガイモＹウイルス（PVY）
　（８）タバコ微班モザイクウイルス（TMGMV）
　（９）タバコモザイクウイルス（TMV）
　（10）トマトアスパーミィウイルス（TAV）
　（11）トマトモザイクウイルス（ToMV）

（１）アブラムシ類の寄生によってウイルスが伝染し、被害が広がる。（２）種子伝染・土壌伝染や感染植物の汁液に触れた手によっても伝染する。（３）汁液伝染、アブラムシによる非永続伝染（アブラムシの子孫を介しての伝染はない）、種子伝染。（４）アブラムシによる非永続伝染、汁液伝染。（５）汁液伝染、土壌伝染、種子伝染。（６）汁液伝染、アブラムシによる非永続伝染、接ぎ木伝染。（７）汁液伝染、アブラムシによる非永続伝染（モモアカアブラムシ、チューリップヒゲナガアブラムシ、ワタアブラムシ）。（８）汁液伝染、種子伝染。（９）接触伝染（汁液伝染、土壌伝染、種子伝染）。（10）汁液伝染、アブラムシによる非永続伝染、ハコベでは種子伝染。（11）接触伝染（汁液伝染、土壌伝染、種子伝染）。

育苗時期にアブラムシの飛来を防止することが大切。アブラムシの発生の多い時期の育苗では、寒冷紗被覆下で栽培する。圃場では、シルバーポリマルチなどによってアブラムシの飛来を防止する。ウイルスによっては土壌伝染、種子伝染があるので注意が必要。PMMoVについては抵抗性品種「京鈴」「京ひかり」などがある。感染植物については早めに除去し、被害株に触れた手で、健全植物に触れないようにする。

注．2003年の改正農薬取締法施行にともなって、これまであいまいであったピーマンとトウガラシ類の区別が明確になった。ここではピーマンに登録されている薬剤を示した。トウガラシ類に使用できないものがあるので注意されたい。トウガラシ類に対する登録はまだ少ないが、積極的に登録が進められており、今後も増える見込みである。