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地上部の茎葉にも、肥大根にも、生育途上で外観上何らの病変も見られない。そのため、収穫期になって発病に気付くことが多い。病変は、肥大根内部の維菅束に現れ、放射状に分布する維菅束に点々と黒変が現れる（黒点病の病名のゆえんである）。萎黄病では皮層直下の維菅束が褐色に変色して、環状に見えるのとは異なる。

病原：糸状菌（かび）
　（１）バーティシリウム　ダーリエ
　（２）バーティシリウム　アルボアトラム
典型的土壌伝染病。本病原菌は多犯性で極めて多くの作物、雑草に寄生して、導管病を起こす。本病原菌の中には、トマトに対する病原性を異にする系統（トマトを侵す／侵さない）が存在する。
発病した植物の遺体（残さ）上に形成された微少な菌核により、土壌中に長期間（数年から十数年）生存する。ダイコンの根が菌核の近くに伸びてくると、菌核は発芽して感染する。
病原菌は比較的冷涼な気候を好み、発病適温は20〜24℃である。土壌湿度はやや低い方を好み、湛水状態には弱い。土壌反応は酸性側よりもアルカリ側で発生が多くなる傾向にある。
本病原菌の伝染経路は、前作の被害作物残さのすき込みや病原菌に汚染した（病原菌の菌核の混入した）堆肥の施用による圃場での土壌伝染、大小農機具、履き物、資材、強風、豪雨などによる汚染土壌の移動、病原菌に汚染した種子を介する伝染などが挙げられる。

被害発生圃場では連作を避ける。罹病残さを圃場に放置すると、病原菌の休眠器官が多数形成され、土壌中の病原菌密度が上昇し、栽培できなくなる。水田との輪作は被害が軽減される。発病圃場では土壌消毒が有効である。
防除薬剤として、キルパー、バスアミド微粒剤、ソイリーンが利用できる。