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播種した種子が、発芽後土壌中で腐敗（出芽前立枯れ）したり、いったん出芽した後、地下部が腐敗したり、地際部の胚軸が褐変し、くびれて枯れる（出芽後立枯れ）。被害を受けた部分には、褐色のクモの巣状のかびが見えることがある。

病原：糸状菌（かび）　リゾクトニア　ソラニ
病原菌は高温性であり、高温期の育苗は常に本病の危険にさらされる。
病原菌は菌核を作って被害作物残さ上で生存するほか、土壌中の新鮮有機物（植物の遺体）を利用して増殖することができる。
ナス苗立枯病は、ピロシウム、ミリオタイラム、ピシウム アファニデルマータムの感染によっても発生する。

育苗用土には、育苗用の新しい土を用いるか、蒸気消毒した土を用いる。育苗資材・育苗床については、圃場衛生管理を徹底することが大切。播種から育苗期は、加温・加湿な栽培となることから、入念な圃場衛生管理を行うことが大切。
苗立枯病には、リゾレックス水和剤、オーソサイド水和剤80による潅注処理が登録されている。ピシウム属菌による苗立枯病には、オーソサイド水和剤80の防除効果が高い。